Cốt truyện của game xoay quanh truyền thuyết về 2 con rồng cổ xưa, một luôn bảo vệ loài người, còn một luôn tìm cách hủy diệt tất cả. Hai con rồng sẽ cùng thức tỉnh khi 2 người anh hùng mang trong mình dấu ấn rồng chạm trán nhau.
Nhân vật chính của Fire Emblem: Awakening là Chrom, hoàng tử xứ Iris. Trên đường tham gia trận chiến để chống lại sự xâm lược của nước láng giềng Plegia, Chrom và em gái bắt gặp 1 nhân vật bị mât trí nhớ. Nhân vật này sẽ do người chơi tự tạo ra và bạn sẽ là vai chính thứ 2 trong cốt truyện. Không lâu sau cuộc gặp gỡ đó, cả hai sẽ đụng độ với 1 thế lực ma quỷ đang dần dần lan rộng và 1 kiếm sỹ bí ẩn đeo mặt nạ, tự xưng là Hero King trong truyền thuyết - Marth.
Fire Emblem: Awakening sẽ có 9 class mới, nâng tổng số class lên 44. Hệ thống mới Dual Battle cho phép nhân vật support cùng tham gia vào 1 battle để thực hiện Team attack hoặc trực tiếp đỡ đòn cho người chơi. Bổ sung chế độ camera First Person View trong battle để thưởng thức hiệu ứng 3D không cần kính. Ngoài lựa chọn skip hoàn toàn animation, giờ đây có thêm lựa chọn tua nhanh animation trong battle.
Có một đặc điểm nổi bật của dòng game Fire Emblem từ xưa đến nay, đó là các unit bị chết trong 1 trận chiến sẽ vĩnh viễn ra đi. Trong phiên bản mới này có bổ sung thêm 1 chế độ dễ cho phép các unit bị chết hồi sinh sau trận đấu. Nhưng đương nhiên với các fan hardcore thì phải chơi Lunatic Mode rồi. Hệ thống kết hôn, sinh con của Fire Emblem 4 trở lại trong Fire Emblem: Awakening và đóng vai trò quan trọng trong battle vì khả năng support cực kỳ mạnh mẽ của các thành viên trong cùng gia đình.
Thông qua những cuộc đối thoại, nhân vật của bạn sẽ dần dần củng cố mối quan hệ với các nhân vật khác giới. Đến khi thời điểm chín mùi bạn sẽ có thể ngỏ lời cầu hôn, nếu lời câu hôn của bạn được chấp thuận sẽ có 1 cảnh lãng mạn ngắn. Không lâu sau đó các nhân vật "đời 2" sẽ được sinh ra và có thể nhanh chóng tham gia chiến trận cùng cha mẹ mình. Nếu khởi tạo nhân vật là nữ thì cũng sẽ có tới 12 chàng trai theo đuổi bạn, họ là ai thì xin để dành để các bạn tự khám phá.